Od ujawnienia szczegółów operacji Black Briar minęło 10 lat. Bourne wciąż żyje w ukryciu. Udało mu się poznać swoją tożsamość i wyrównać rachunki. Z kolei Nicky Parsons, związana z grupą hakerów kierowanych przez Christiana Dassaulta, włamuje się do komputerów amerykańskiego wywiadu. Wykrada tajne informacje dotyczące kolejnych projektów. To zwraca uwagę Heather Leen, mającej pieczę nad cybernetycznymi operacjami, i samego dyrektora agencji, Roberta Deweya. Parsons udaje się znaleźć dokumenty dotyczące byłego szpiega i jego rekrutacji do programu Treadstone. Okazuje się, że w sprawę zamieszany jest ojciec mężczyzny. Nicky zostaje zabita, kiedy leci do Aten, żeby poinformować o wszystkim Jasona. Ten znów musi stawić czoło dawnym wrogom.