Perypetie tchórzliwego psa Scooby'ego Doo oraz jego przyjaciół - Kudłatego, Freda, Daphne i Velmy. W trakcie wakacji młodzi detektywi wyruszają w niezapomnianą podróż Wehikułem Tajemnic. W jej trakcie podejmują się rozwiązania zagadek kryminalnych, w których dużą rolę odgrywają wątki paranormalne.Detektywi wyruszają w rejs statkiem, którego kapitanem jest kuzyn Freda. Tymczasem Velma bardzo boi się wody. Niebawem przerażający potwór morski atakuje statek.