Wkraczający w dorosłość młody czarnoksiężnik Merlin (Colin Morgan) broni Królestwa Camelot i jego władców przed wrogami. Szczególną opieką otacza młodego księcia Arthura (Bradley James), który w tej serii zostaje koronowany na króla. Czarodziej próbuje pokrzyżować szyki demonicznej Morganie (Katie McGrath) i innym przedstawicielom sił zła. Wielokrotnie stawia czoła mitycznym, jak i rzeczywistym wrogom. Dzięki walce z mrocznymi mocami Merlin zdobywa tajemną wiedzę, która w przyszłości pozwoli mu zdobyć sławę potężnego czarnoksiężnika.Zbliża się dzień urodzin księcia Arthura. Z tej okazji jego bliscy i poddani z zamku Camelot przygotowują uroczyste przyjęcie. Tymczasem dawny wróg przyszłego monarchy, król Odin, postanawia wykorzystać imprezę i zemścić się na Arthurze. Wynajmuje płatnego zabójcę, aby wmieszał się w tłum gości i w odpowiednim momencie zaatakował księcia. W efekcie działań Odina w królestwie zaczyna panować chaos. Merlin robi wszystko, by opanować sytuację i zapobiec katastrofie. Arthur zostaje koronowany na króla.