Obdarzony zmysłem detektywistycznym proboszcz parafii w Sandomierzu, ksiądz Mateusz Żmigrodzki (Artur Żmijewski), pomaga miejscowemu komisarzowi Możejce (Piotr Polk) i jego podwładnym w rozwiązywaniu kolejnych skomplikowanych zagadek kryminalnych.Delegacja naukowców z Instytutu Badań Jądrowych przyjeżdża do Sandomierza, w tym światowej sławy profesor Karol Werner, który pracuje nad zimną fuzją. Chcą przedstawić mieszkańcom zalety budowy elektrowni atomowej. Do miasta ma też zawitać nadinspektor policji w stopniu generała. Morus stara się więc wykazać przed zwierzchnikiem. W pośpiechu szuka nierozwiązanych spraw, by móc stworzyć sandomierskie Archiwum X. Tymczasem okazuje się, że profesor Werner po spotkaniu z ks. Mateuszem nie wrócił do hotelu. Miał udać się do swojej dawnej miłości, Zofii. Lokalni policjanci czują, że ta sprawa może ich przerosnąć. Nie wiedzą, czy doszło do porwania, czy zabójstwa. Na dodatek pojawiają się sprzeczne tropy. Do akcji wkraczają nurkowie, którzy przeszukują rzekę, a także warszawscy policjanci. Komendant Morus naciska na podwładnych, by przyspieszyć rozwiązanie sprawy. Ks. Mateusz ma swoje podejrzenia. Z kolei babcia Lucyna w tym wielkim zamieszaniu odkrywa w sobie pasję do fizyki kwantowej.