Przygody rodziny Nektonów, która mieszka na pokładzie łodzi podwodnej "Aronax" i, dysponując wysoko zaawansowanymi technologiami, wyrusza w niezbadane morskie odmęty. Bohaterowie troszczą się o podwodny świat, wiedząc, że grożą mu różne niebezpieczeństwa. Bronią się przed atakami pirackimi, zmagają z telewizyjnym gwiazdorem i walczą z firmami zanieczyszczającymi środowisko. Nektonowie próbują odnaleźć Lemurię, tajemniczą krainę, rzekomo zamieszkałą przez ich przodków.W głębinach oceanu odzywa się zagadkowy dźwięk, znany jako bloop. Nektonowie podejmują próbę odkrycia jego źródła. Podczas poszukiwań trafiają na maszynę, która staje się dla nich przeszkodą w dalszych badaniach.